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量子化學計算軟體 Gaussian[1] :量子化學領域最著名和應用最廣泛的軟體之一,由量子化學家約翰·波普的實驗室開發,可以應用從頭算方法、半經驗計算方法等進行分子能量和結構;過渡態能量和結構;化學鍵及反應能量;分子軌道;偶極矩;多極矩;紅外光譜和拉曼光譜,核磁共振,極化率和超極化率,熱力學性質,反應路徑等分子相關計算。可以運行在Windows、Linux、Mac作業系統中運行,目前最新版本為Gaussian 09。但由於Gaussian Inc.(Gaussian的發展者)排斥其他軟體發展者的行為,而引來不少批評;其行為包括逐使原開發者約翰·波普離開Gaussian Inc.(因而成為學術界其中一件為人齒冷的事件);禁止其他開發者(包括約翰·波普在內)使用Gaussian(引發起Banned By Gaussian運動[3])和禁止任何使用者發表比較Gaussian與其他量子化學軟體效能的報告等。 Gamess-US[2] :由於免費與開放源碼,成為除Gaussian以外,最廣泛應用的量子化學軟體,目前由Iowa State Uinversity的Mark Gorden教授的研究組主理。 Q-Chem[3] :由一群隨約翰·波普離開Gaussian Inc.的學者創立的一個商業量子化學軟體。 Spartan[4] :提供一個十分優良的圖形介面作量子化學計算,尤其適合非從事量子化學研究的學者使用。此軟體中有很大部的電子相關方法的計算程序實源自Q-Chem,所以當使用到該些計算方法而作出報告時,應同時於文獻參考中引述Spartan與Q-Chem。 CASTEP[5] :為一量子力學為基礎的週期性固態材料化學計算的套裝軟體,此程式由英國劍橋大學卡文迪許實驗室(Cavendish Laboratory)的凝態物理理論組所共同研究開發。CASTEP是由密度泛函理論為基礎的計算程式所組成,同時採用平面波(plane wave)為基底處理波函數,可針對具有週期性的固態材料表面進行化學模擬計算,而此軟體更具有高精準度以及高效能計算能力的表現。 MOLPRO[6] :應用廣泛的量子化學計算軟體,軟體長於高精度計算,用多參考CI,耦合簇等方法處理電子相關問題能夠對較大的分子體系進行準確的從頭計算。 MOPAC[7] :應用最廣泛的半經驗量子化學計算軟體,能夠以AM1,AM1-d,PM3,MNDO,MNDO-d,MINDO/3等半經驗計算方法計算分子體系的自由能,活化能,反應路徑,偶極矩,非線性光學特性以及紅外光譜等性質。MOPAC 7以前的版本為免費軟體,自MOPAC 7開始轉為商業軟體,目前最新版本為MOPAC2007。 MOLCAS[8] :是一套包含各種量子化學計算方法的軟體,可以進行分子結構計算,鍵能,化學反應的能壘,激發能(包括自旋-軌道耦合),振動分辨吸收光譜,以及各種分子特性的計算,並且可以產生分子間的作用力,用於分子動力學的計算。目前最新版本為MOLCAS 7。 CP2K[9]:應用廣泛的量子化學和凝聚態物理計算軟體,它可以模擬固體材料,溶液,分子,晶體,生物體系。CP2K提供了多元化的理論方法包括DFTB, LDA, GGA, MP2, RPA, 半經驗方法包括 (AM1, PM3, PM6, RM1, MNDO, xTB), 和精典力場(AMBER, CHARMM, …). CP2K可以模擬分子動力學,Metadynamics,模特卡羅,Ehrenfest動力學,頻率分析,核激發光譜,能量優化,過渡態尋找(NEB, Dimer)。 其他量子化學計算軟體目前,除了上面提到的幾版著名量子化學計算軟體之外,還有大量商業和免費的量子化學計算軟體,其中絕大部分是從事量子化學或計算化學研究的實驗室自行開發的,此外,一些著名的大型化學軟體如HyperChem、Chem3D、Sybyl等,也包含有量子化學計算包。
量子化學計算軟體
Gaussian[1] :量子化學領域最著名和應用最廣泛的軟體之一,由量子化學家約翰·波普的實驗室開發,可以應用從頭算方法、半經驗計算方法等進行分子能量和結構;過渡態能量和結構;化學鍵及反應能量;分子軌道;偶極矩;多極矩;紅外光譜和拉曼光譜,核磁共振,極化率和超極化率,熱力學性質,反應路徑等分子相關計算。可以運行在Windows、Linux、Mac作業系統中運行,目前最新版本為Gaussian 09。但由於Gaussian Inc.(Gaussian的發展者)排斥其他軟體發展者的行為,而引來不少批評;其行為包括逐使原開發者約翰·波普離開Gaussian Inc.(因而成為學術界其中一件為人齒冷的事件);禁止其他開發者(包括約翰·波普在內)使用Gaussian(引發起Banned By Gaussian運動[3])和禁止任何使用者發表比較Gaussian與其他量子化學軟體效能的報告等。
Gamess-US[2] :由於免費與開放源碼,成為除Gaussian以外,最廣泛應用的量子化學軟體,目前由Iowa State Uinversity的Mark Gorden教授的研究組主理。
Q-Chem[3] :由一群隨約翰·波普離開Gaussian Inc.的學者創立的一個商業量子化學軟體。
Spartan[4] :提供一個十分優良的圖形介面作量子化學計算,尤其適合非從事量子化學研究的學者使用。此軟體中有很大部的電子相關方法的計算程序實源自Q-Chem,所以當使用到該些計算方法而作出報告時,應同時於文獻參考中引述Spartan與Q-Chem。
CASTEP[5] :為一量子力學為基礎的週期性固態材料化學計算的套裝軟體,此程式由英國劍橋大學卡文迪許實驗室(Cavendish Laboratory)的凝態物理理論組所共同研究開發。CASTEP是由密度泛函理論為基礎的計算程式所組成,同時採用平面波(plane wave)為基底處理波函數,可針對具有週期性的固態材料表面進行化學模擬計算,而此軟體更具有高精準度以及高效能計算能力的表現。
MOLPRO[6] :應用廣泛的量子化學計算軟體,軟體長於高精度計算,用多參考CI,耦合簇等方法處理電子相關問題能夠對較大的分子體系進行準確的從頭計算。
MOPAC[7] :應用最廣泛的半經驗量子化學計算軟體,能夠以AM1,AM1-d,PM3,MNDO,MNDO-d,MINDO/3等半經驗計算方法計算分子體系的自由能,活化能,反應路徑,偶極矩,非線性光學特性以及紅外光譜等性質。MOPAC 7以前的版本為免費軟體,自MOPAC 7開始轉為商業軟體,目前最新版本為MOPAC2007。
MOLCAS[8] :是一套包含各種量子化學計算方法的軟體,可以進行分子結構計算,鍵能,化學反應的能壘,激發能(包括自旋-軌道耦合),振動分辨吸收光譜,以及各種分子特性的計算,並且可以產生分子間的作用力,用於分子動力學的計算。目前最新版本為MOLCAS 7。
CP2K[9]:應用廣泛的量子化學和凝聚態物理計算軟體,它可以模擬固體材料,溶液,分子,晶體,生物體系。CP2K提供了多元化的理論方法包括DFTB, LDA, GGA, MP2, RPA, 半經驗方法包括 (AM1, PM3, PM6, RM1, MNDO, xTB), 和精典力場(AMBER, CHARMM, …). CP2K可以模擬分子動力學,Metadynamics,模特卡羅,Ehrenfest動力學,頻率分析,核激發光譜,能量優化,過渡態尋找(NEB, Dimer)。
其他量子化學計算軟體目前,除了上面提到的幾版著名量子化學計算軟體之外,還有大量商業和免費的量子化學計算軟體,其中絕大部分是從事量子化學或計算化學研究的實驗室自行開發的,此外,一些著名的大型化學軟體如HyperChem、Chem3D、Sybyl等,也包含有量子化學計算包。